劇情簡介
Synopsis故事講述的是從東京都西部被分割出來的這座都市中，“超能力開發”被列為學校課程的一部分（學生作為人體科學實驗物件）。在二百三十萬人口中，有八成都是學生，所以被稱為學園都市。他們每天都在超能力開發上進行相互競爭。根據能力高低不同，可以分為7級，從無能力（level 0）到超能力（level 5）（level 6為絕對能力者）。故事的主角上條當麻是學園裡的一個無能力者，但並非完全沒有能力，他的能力是能夠將一切異能之力無效化。他只有右手能夠使用這種能力，還給自己的這種連上帝的奇蹟都能抹殺的能力取名為幻想殺手（Imagine-breaker）。而正因為他的右手似乎把神的祝福都給抹殺掉的緣故，導致自己一直過著不幸的生活。某一個暑假的日子，在家裡的陽臺上，他遇見了一位修女；這位少女自稱自己的名字叫“茵蒂克絲”（Index），並是從魔法的世界逃了出來，現在正在被魔法師追趕中。就這樣，上條當麻一腳踏進了奇妙而美麗又黑暗的世界，開始了上條當麻與御坂美琴的戰鬥……掌握了十萬三千本究極魔法書（魔導書）的少女與擁有抹殺一切奇蹟的神上之手的少年，將面臨一系列故事……
分集劇情
Episodes 共 24 集
第 1 集
學園都市
這是一座佔據東京西方大部分割槽域的巨大都市。由於230萬居民之中有八成是學生，因此這裡被稱為“學園都市”，而且居住在這裡的學生們，必須接受開發超能力的特殊教育。學園都市的某名高中生上條當麻，被判定為及格邊緣的無能力者（LV0），因為他的右手擁有“消除所有異能之力”的神秘力量。而且右手的這種力量，甚至將他身上的“神的庇護”一併消除，使得他總是過著不幸的人生。在暑假的某一天，一名純白的修女從天而降來到上條的房間，這名少女表示，她是從“魔術”的世界逃離出來的人。
這是一座佔據東京西方大部分割槽域的巨大都市。由於230萬居民之中有八成是學生，因此這裡被稱為“學園都市”，而且居住在這裡的學生們，必須接受開發超能力的特殊教育。學園都市的某名高中生上條當麻，被判定為及格邊緣的無能力者（LV0），因為他的右手擁有“消除所有異能之力”的神秘力量。而且右手的這種力量，甚至將他身上的“神的庇護”一併消除，使得他總是過著不幸的人生。在暑假的某一天，一名純白的修女從天而降來到上條的房間，這名少女表示，她是從“魔術”的世界逃離出來的人。
第 2 集
獵殺魔女之王-Innocentius-
為了參加暑修，總之上條先把神秘修女藏在自己的房間。然而在他回家之後，卻發現茵蒂克絲躺在血泊中。這是追捕她的魔術師下的手。紅髮，眼睛下方有條碼，身穿漆黑的修道服。自稱史提爾．馬格努斯的這名高瘦青年，忽然朝著上條詠唱符文魔術……！遭遇火焰魔人“獵殺魔女之王”的襲擊，上條陷入九死一生的危機，然而應該昏迷不醒的茵蒂克絲，卻張開眼睛開始說出神秘的話語。
為了參加暑修，總之上條先把神秘修女藏在自己的房間。然而在他回家之後，卻發現茵蒂克絲躺在血泊中。這是追捕她的魔術師下的手。紅髮，眼睛下方有條碼，身穿漆黑的修道服。自稱史提爾．馬格努斯的這名高瘦青年，忽然朝著上條詠唱符文魔術……！遭遇火焰魔人“獵殺魔女之王”的襲擊，上條陷入九死一生的危機，然而應該昏迷不醒的茵蒂克絲，卻張開眼睛開始說出神秘的話語。
第 3 集
必要之惡教會-Necessarius-
茵蒂克絲髮動“自動書記”，使上條勉強逃離險境。再度陷入昏迷的茵蒂克絲，需要以魔術來治療傷勢，然而經過開發而得到超能力的人要是使用魔術，似乎就會全身出血而死，因此上條前往月詠小萌的公寓，想請這位沒有超能力的導師幫忙。上條右手擁有的能力，甚至連治療茵蒂克絲的回覆魔術都會消除，所以上條只能在小萌的公寓外面待命，他也因為自己幫不上忙而感到憤怒。就這樣，茵蒂克絲藉由小萌成功發動回覆魔術，並且開始述說自己正在面對的問題——包括正在追捕她的魔術結社，以及自己所擁有的魔道書。
茵蒂克絲髮動“自動書記”，使上條勉強逃離險境。再度陷入昏迷的茵蒂克絲，需要以魔術來治療傷勢，然而經過開發而得到超能力的人要是使用魔術，似乎就會全身出血而死，因此上條前往月詠小萌的公寓，想請這位沒有超能力的導師幫忙。上條右手擁有的能力，甚至連治療茵蒂克絲的回覆魔術都會消除，所以上條只能在小萌的公寓外面待命，他也因為自己幫不上忙而感到憤怒。就這樣，茵蒂克絲藉由小萌成功發動回覆魔術，並且開始述說自己正在面對的問題——包括正在追捕她的魔術結社，以及自己所擁有的魔道書。
第 4 集
完全記憶能力
追捕茵蒂克絲的魔術師，並不是只有史提爾而已。手持長刀的女性魔法師神裂火織，以高超的劍技壓制住上條。神裂希望在殺掉上條之前就能將茵蒂克絲帶回“保護”，雖然傷痕累累的上條依然拼命反抗，然而面對神裂使用的魔術“七閃”，也只能束手無策倒地不起。在意識逐漸朦朧的時候，上條詢問神裂沒有對他下殺手的理由，並且提出種種的疑問。就在上條緩緩閉上眼睛的時候，神裂說出了驚人的真相。茵蒂克絲所揹負的奇特命運，以及"完全記憶能力"帶來的悲劇為何？
追捕茵蒂克絲的魔術師，並不是只有史提爾而已。手持長刀的女性魔法師神裂火織，以高超的劍技壓制住上條。神裂希望在殺掉上條之前就能將茵蒂克絲帶回“保護”，雖然傷痕累累的上條依然拼命反抗，然而面對神裂使用的魔術“七閃”，也只能束手無策倒地不起。在意識逐漸朦朧的時候，上條詢問神裂沒有對他下殺手的理由，並且提出種種的疑問。就在上條緩緩閉上眼睛的時候，神裂說出了驚人的真相。茵蒂克絲所揹負的奇特命運，以及"完全記憶能力"帶來的悲劇為何？
第 5 集
十二時-Limit-
由於腦中存放著十萬三千本魔道書的內容，因此茵蒂克絲能使用的腦容量只有平常人的十五%。因為擁有完全記憶能力，要是沒有每年消除記憶就會死亡。得知這個事實的上條，收到了神裂的連絡。時限是凌晨零時，茵蒂克絲過了這個期限就會死，因此神裂要上條在時限之前與茵蒂克絲道別。
由於腦中存放著十萬三千本魔道書的內容，因此茵蒂克絲能使用的腦容量只有平常人的十五%。因為擁有完全記憶能力，要是沒有每年消除記憶就會死亡。得知這個事實的上條，收到了神裂的連絡。時限是凌晨零時，茵蒂克絲過了這個期限就會死，因此神裂要上條在時限之前與茵蒂克絲道別。
第 6 集
幻想殺手-Imagine Breaker-
茵蒂克絲必須每年消除記憶的原因，並不是因為完全記憶能力壓迫她的腦部，也不是因為她記住十萬三千本魔道書的內容。依循著一絲格格不入的感覺，上條終於發現真相，並且以右手的“幻想殺手”，破壞了教會施加在茵蒂克絲腦部的某種“機關”。
茵蒂克絲必須每年消除記憶的原因，並不是因為完全記憶能力壓迫她的腦部，也不是因為她記住十萬三千本魔道書的內容。依循著一絲格格不入的感覺，上條終於發現真相，並且以右手的“幻想殺手”，破壞了教會施加在茵蒂克絲腦部的某種“機關”。
第 7 集
三澤塾-科學崇拜-
基於某些原因，上條帶著茵蒂克絲及兩名同班同學前往速食店。由於店裡客滿，他們只好與別人共桌，與他們共桌的則是一名自稱“魔法師”的巫女。身上的錢不夠搭電車的她，後來與身穿西裝的補習班老師們離去。經過這次奇妙的邂逅之後，史提爾．馬格努斯出現在上條的面前。
基於某些原因，上條帶著茵蒂克絲及兩名同班同學前往速食店。由於店裡客滿，他們只好與別人共桌，與他們共桌的則是一名自稱“魔法師”的巫女。身上的錢不夠搭電車的她，後來與身穿西裝的補習班老師們離去。經過這次奇妙的邂逅之後，史提爾．馬格努斯出現在上條的面前。
第 8 集
黃金煉成-Ars Magna-
被囚禁於三澤塾的少女名為姬神秋沙，她正是上條在速食店遇見的少女。與史提爾入侵三澤塾之後，上條看見一具身穿鎧甲的屍體——羅馬正教十三騎士團的遺骸，然而學生們絲毫不以為意。史提爾表示這就像是硬幣的表裡，因為結界的關係，位於硬幣表面的學生們，不會察覺到位於硬幣背面的外敵，而且如果要破壞結界，就必須破壞魔法的“核心”。
被囚禁於三澤塾的少女名為姬神秋沙，她正是上條在速食店遇見的少女。與史提爾入侵三澤塾之後，上條看見一具身穿鎧甲的屍體——羅馬正教十三騎士團的遺骸，然而學生們絲毫不以為意。史提爾表示這就像是硬幣的表裡，因為結界的關係，位於硬幣表面的學生們，不會察覺到位於硬幣背面的外敵，而且如果要破壞結界，就必須破壞魔法的“核心”。
第 9 集
吸血殺手 -Deep Blood-
姬神能吸引吸血鬼，奧雷歐斯需要吸血鬼的力量，這就是姬神與奧雷歐斯共同行動的理由。另一方面，茵蒂克絲追著上條來到三澤塾，卻落入奧雷歐斯的手中。上條與史提爾好不容易找出奧雷歐斯的所在處，然而他們在那裡看見的，卻是熟睡的茵蒂克絲。此時史提爾說出了奧雷歐斯追求力量的理由。得知自己的目的完全付諸流水之後，奧雷歐斯對上條等人露出利牙。面對能將言語化為現實的“黃金煉成”，上條以右手為武器對抗奧雷歐斯。
姬神能吸引吸血鬼，奧雷歐斯需要吸血鬼的力量，這就是姬神與奧雷歐斯共同行動的理由。另一方面，茵蒂克絲追著上條來到三澤塾，卻落入奧雷歐斯的手中。上條與史提爾好不容易找出奧雷歐斯的所在處，然而他們在那裡看見的，卻是熟睡的茵蒂克絲。此時史提爾說出了奧雷歐斯追求力量的理由。得知自己的目的完全付諸流水之後，奧雷歐斯對上條等人露出利牙。面對能將言語化為現實的“黃金煉成”，上條以右手為武器對抗奧雷歐斯。
第 10 集
姐姐-御坂美琴-
由於被捲入茵蒂克絲的事件，上條沒有去參加暑修，因此即使現在是八月下旬，他依然每天要過著補習的生活。在放學回家的途中，自動販賣機吃錢的不幸再度降臨到他的身上，此時就讀常盤臺中學的放電國中生御坂美琴出現了。她使出的“秘技”弄壞了販賣機，兩人只好趕快逃離現場，然而他們面前出現了一名戴著軍用護目鏡，自稱是美琴妹妹的少女“御坂”。
由於被捲入茵蒂克絲的事件，上條沒有去參加暑修，因此即使現在是八月下旬，他依然每天要過著補習的生活。在放學回家的途中，自動販賣機吃錢的不幸再度降臨到他的身上，此時就讀常盤臺中學的放電國中生御坂美琴出現了。她使出的“秘技”弄壞了販賣機，兩人只好趕快逃離現場，然而他們面前出現了一名戴著軍用護目鏡，自稱是美琴妹妹的少女“御坂”。
第 11 集
妹妹們 -Sisters-
上條帶著撿到的黑貓，與御坂前往中古書店尋找養貓相關的書籍。買完書走出店門口一看，外頭只剩下受到驚嚇的黑貓，御坂則是不見蹤影。覺得狀況不對勁的上條，在小巷子裡發現了倒在血泊之中，身穿常盤臺中學制服的少女──御坂妹。
上條帶著撿到的黑貓，與御坂前往中古書店尋找養貓相關的書籍。買完書走出店門口一看，外頭只剩下受到驚嚇的黑貓，御坂則是不見蹤影。覺得狀況不對勁的上條，在小巷子裡發現了倒在血泊之中，身穿常盤臺中學制服的少女──御坂妹。
第 12 集
絕對能力 -Level 6-
御坂表示自己是美琴的複製人，負責在“實驗”裡擔任被殺的角色。為了確認這些“妹妹們”與這個“實驗”的真相，上條前往美琴的住處，並且得知美琴被捲入的事件內容，因而連忙外出尋找美琴。御坂們所進行的實驗，是要讓學園都市最強的LV5超能力者“一方通行”進化到前所未有的LV6。御坂們之所以會被量產成為犧牲品，是因為美琴曾經提供自己的基因做研究。
御坂表示自己是美琴的複製人，負責在“實驗”裡擔任被殺的角色。為了確認這些“妹妹們”與這個“實驗”的真相，上條前往美琴的住處，並且得知美琴被捲入的事件內容，因而連忙外出尋找美琴。御坂們所進行的實驗，是要讓學園都市最強的LV5超能力者“一方通行”進化到前所未有的LV6。御坂們之所以會被量產成為犧牲品，是因為美琴曾經提供自己的基因做研究。
第 13 集
一方通行-Accelerator-
打算犧牲自己拯救“妹妹們”的美琴，毫不留情朝著擋路的上條使出雷擊，然而上條完全沒有使用右手的意思。美琴詢問他為何要不惜這麼做，上條則是說出了一個令人意外的想法。如果要阻止實驗的進行，只要將“一方通行是最強超能力者”這個實驗的大前提推翻就行了。
打算犧牲自己拯救“妹妹們”的美琴，毫不留情朝著擋路的上條使出雷擊，然而上條完全沒有使用右手的意思。美琴詢問他為何要不惜這麼做，上條則是說出了一個令人意外的想法。如果要阻止實驗的進行，只要將“一方通行是最強超能力者”這個實驗的大前提推翻就行了。
第 14 集
最強vs最弱
上條在御坂九死一生的時候趕到，面對“一方通行”的強勁實力，上條被逼著只能防守。然而上條反射性揮出去的“右手”，卻打中了“一方通行”的臉。由於擁有壓倒性的強勁，因此“一方通行”至今從來沒有經歷過近身肉搏戰，就這麼被上條的右拳痛毆。
上條在御坂九死一生的時候趕到，面對“一方通行”的強勁實力，上條被逼著只能防守。然而上條反射性揮出去的“右手”，卻打中了“一方通行”的臉。由於擁有壓倒性的強勁，因此“一方通行”至今從來沒有經歷過近身肉搏戰，就這麼被上條的右拳痛毆。
第 15 集
天使墜落-Angel Fall-
身為LV0卻打倒一方通行，使得上條一下子變成名人，因此理事會命令他在事情平息之前暫時離開學園都市。明明沒有身分證，卻不知為何可以順利離開學園都市的茵蒂克絲，就這麼和上條一起來到了理事會安排的溫泉旅館“海神”，小萌老師也好意安排上條的家人與他會面。隔天早上，上條的父親刀夜等人抵達旅館……然而母親詩菜卻是茵蒂克絲，表妹乙姬則是美琴？
身為LV0卻打倒一方通行，使得上條一下子變成名人，因此理事會命令他在事情平息之前暫時離開學園都市。明明沒有身分證，卻不知為何可以順利離開學園都市的茵蒂克絲，就這麼和上條一起來到了理事會安排的溫泉旅館“海神”，小萌老師也好意安排上條的家人與他會面。隔天早上，上條的父親刀夜等人抵達旅館……然而母親詩菜卻是茵蒂克絲，表妹乙姬則是美琴？
第 16 集
父親-上條刀夜-
出現在上條面前的紅衣修女名為米夏·克洛伊潔芙，所屬單位是俄羅斯成教的“殲滅白書”。她之所以來到日本，是為了要尋找造成世界異象的大規模魔法“天使墜落”的源頭。在同一時間，英國清教“必要之惡教會”的兩名魔法師也現身了，而且其中一人是上條的同學土御門。
出現在上條面前的紅衣修女名為米夏·克洛伊潔芙，所屬單位是俄羅斯成教的“殲滅白書”。她之所以來到日本，是為了要尋找造成世界異象的大規模魔法“天使墜落”的源頭。在同一時間，英國清教“必要之惡教會”的兩名魔法師也現身了，而且其中一人是上條的同學土御門。
第 17 集
大天使-神之力-
如果要阻止大規模魔法“天使墜落”，就必須打倒術者或是破壞儀式現場。由於米夏出現一些可疑的行動，上條與土御門推測她就是術者，連忙追著她前往上條家。先行一步抵達上條家的兩人，在家裡看見刀夜的照片，赫然發現刀夜的外表並沒有被替換，但是隻有術者不會受到魔法的影響。
如果要阻止大規模魔法“天使墜落”，就必須打倒術者或是破壞儀式現場。由於米夏出現一些可疑的行動，上條與土御門推測她就是術者，連忙追著她前往上條家。先行一步抵達上條家的兩人，在家裡看見刀夜的照片，赫然發現刀夜的外表並沒有被替換，但是隻有術者不會受到魔法的影響。
第 18 集
冒牌貨-複製品-
暑假的最後一天，上條面對空白的暑假作業陷入苦戰。另一方面，御坂美琴則是過著一如往常的生活。在照例出門要到便利商店看免費漫畫的時候，一名男性在學校宿舍的門口等待著她。這名男性名為海原光貴，是常盤臺中學理事長的兒子，最近老是纏著美琴不放。不想和這個人打交道的美琴，逮到湊巧路過的上條，要上條在今天假扮成她的男朋友逼海原死心。
暑假的最後一天，上條面對空白的暑假作業陷入苦戰。另一方面，御坂美琴則是過著一如往常的生活。在照例出門要到便利商店看免費漫畫的時候，一名男性在學校宿舍的門口等待著她。這名男性名為海原光貴，是常盤臺中學理事長的兒子，最近老是纏著美琴不放。不想和這個人打交道的美琴，逮到湊巧路過的上條，要上條在今天假扮成她的男朋友逼海原死心。
第 19 集
最後之作-Last Order-
自從“絕對能力進化計劃”失敗──“一方通行”敗給上條之後，每天都遭受到不良少年的襲擊。某天，一方通行在買完東西回家的途中，出現一名披著破布的少女。她是“妹妹們”之一，編號20001的“最後之作”。她表示因為實驗中止，自己的身體停留在成長途中的階段，卻沒辦法與研究員取得連絡，就這麼擅自跟著一方通行回到家裡。
自從“絕對能力進化計劃”失敗──“一方通行”敗給上條之後，每天都遭受到不良少年的襲擊。某天，一方通行在買完東西回家的途中，出現一名披著破布的少女。她是“妹妹們”之一，編號20001的“最後之作”。她表示因為實驗中止，自己的身體停留在成長途中的階段，卻沒辦法與研究員取得連絡，就這麼擅自跟著一方通行回到家裡。
第 20 集
最終訊號-Virus Code-
“最後之作”是負責統管“御坂網路”的個體。一方通行前往“絕對能力進化計畫”的研究員芳川桔梗面前，希望把“最後之作”還給研究所，然而芳川卻說出“最後之作”目前面臨的危機。由於她的腦中被寫入某個命令，“妹妹們”將會在九月一日的凌晨失控，而且她已經被天井亞雄帶走了。
“最後之作”是負責統管“御坂網路”的個體。一方通行前往“絕對能力進化計畫”的研究員芳川桔梗面前，希望把“最後之作”還給研究所，然而芳川卻說出“最後之作”目前面臨的危機。由於她的腦中被寫入某個命令，“妹妹們”將會在九月一日的凌晨失控，而且她已經被天井亞雄帶走了。
第 21 集
真相不明-Counter Stop-
上條的漫長暑假終於結束，新的學期就此開始，寄住在小萌老師家的姬神秋沙，以轉學生的身分進入上條的班級。另一方面，負責看家的茵蒂克絲，察覺到上條沒為她準備午餐的事實而來到學校，卻被小萌老師趕了出去，即使因為迷路而進入食堂，茵蒂克絲也因為不會買食堂的餐券。後來一名神秘少女──風斬冰華出現在她的面前。
上條的漫長暑假終於結束，新的學期就此開始，寄住在小萌老師家的姬神秋沙，以轉學生的身分進入上條的班級。另一方面，負責看家的茵蒂克絲，察覺到上條沒為她準備午餐的事實而來到學校，卻被小萌老師趕了出去，即使因為迷路而進入食堂，茵蒂克絲也因為不會買食堂的餐券。後來一名神秘少女──風斬冰華出現在她的面前。
第 22 集
石巨人-Golem-
放學之後，上條、茵蒂克絲與風斬一起前往地下街。三人一起吃飯一起玩，茵蒂克絲與風斬還換上《魔法少女加奈美》的衣服拍照，可說是玩得相當開心，不過擔任風紀委員的少女卻叫住了他們，表示由於要逮捕入侵學園都市的恐怖份子，地下街即將暫時封鎖。三人依照指示移動的時候，發現牆壁上居然有一顆眼睛。
放學之後，上條、茵蒂克絲與風斬一起前往地下街。三人一起吃飯一起玩，茵蒂克絲與風斬還換上《魔法少女加奈美》的衣服拍照，可說是玩得相當開心，不過擔任風紀委員的少女卻叫住了他們，表示由於要逮捕入侵學園都市的恐怖份子，地下街即將暫時封鎖。三人依照指示移動的時候，發現牆壁上居然有一顆眼睛。
第 23 集
風斬冰華-朋友-
地下街陷入混亂的局面。與上條分頭行動的風斬，遇見了潛入學園都市的魔法師雪莉．克倫威爾召喚的石巨人。在千鈞一髮之際，從小萌老師口中得知風斬秘密的上條趕來了。雖然風斬認為自己不應該與茵蒂克絲在一起，但上條表示“我只是來拯救朋友而已”，並且與警衛們同心協力對付石巨人。
地下街陷入混亂的局面。與上條分頭行動的風斬，遇見了潛入學園都市的魔法師雪莉．克倫威爾召喚的石巨人。在千鈞一髮之際，從小萌老師口中得知風斬秘密的上條趕來了。雖然風斬認為自己不應該與茵蒂克絲在一起，但上條表示“我只是來拯救朋友而已”，並且與警衛們同心協力對付石巨人。
第 24 集
虛數學區·五行機關
沒能打倒上條與風斬的雪莉，將目標改成了茵蒂克絲，上條與風斬則是各自展開保護茵蒂克絲的行動。在地下鐵隧道與雪莉對峙的上條，從雪莉的口中得知她戰鬥的理由之後提出反駁，然而上條的論點卻激怒雪莉，使得上條陷入被土石活埋的危機。
沒能打倒上條與風斬的雪莉，將目標改成了茵蒂克絲，上條與風斬則是各自展開保護茵蒂克絲的行動。在地下鐵隧道與雪莉對峙的上條，從雪莉的口中得知她戰鬥的理由之後提出反駁，然而上條的論點卻激怒雪莉，使得上條陷入被土石活埋的危機。
